内容説明
本書は、配列解析や構造解析の方法を理解したいと思っている医学生物学者を主たる対象としている。コンピュータプログラムの限界や使い方のストラテジーをはじめ、その根底にあるアルゴリズムや仮定について、理解しやすいように解説した。第２版では、初版では第３章の一部であった“配列アラインメントの確率的、統計的解析入門”に相当する内容を、新たに第４章として独立させ、仮説の検証と配列解析に基づく予測の正確性の検証についての基礎も含めた。第１２章と第１３章は、初版には含まれていなかったＰｅｒｌプログラミングとマイクロアレイ解析を扱っている。
目次
バイオインフォマティクスの歴史と全貌
配列の収集と蓄積
対にした配列のアラインメント
配列アラインメントの確率的、統計的解析入門
多重配列アラインメント
類似配列のデータベース検索
系統推定
ＲＮＡ二次構造の予測
遺伝子予測と遺伝子調節
タンパク質の分類と構造予測
ゲノム解析
ＰｅｒｌとＰｅｒｌモジュールを用いたバイオインフォマティクス・プログラミング
マイクロアレイの解析
著者等紹介
マウント，デービッド Ｗ．［マウント，デービッド Ｗ．］［Ｍｏｕｎｔ，Ｄａｖｉｄ Ｗ．］
米国アリゾナ州ツーソンにある国立アリゾナ癌センター（Ａｒｉｚｏｎａ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ）、およびアリゾナ大学サウスウエスト環境衛生科学センター（Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｃｅｎｔｅｒ）で、バイオインフォマティクス部門の部長を務める。データ管理と情報統合のシステムを開発することと、新しい抗癌薬やマーカー候補として使える遺伝子やタンパク質を同定するための計算科学的手法や統計学的手法を開発することにほとんどの時間を費やしている。Ｐｈ．Ｄ（医学生物物理学分野）
岡崎康司［オカザキヤスシ］
埼玉医科大学ゲノム医学研究センターゲノム科学部門部門長。教授。同トランスレーショナルリサーチ部門、医学研究センター知的財産管理部門部門長兼務。１９８６年、岡山大学医学部卒業後、大阪大学第一内科に入局。大阪警察病院心臓センター、国立循環器病センターを経て循環器内科専門医資格取得。１９９５年大阪大学医学部博士課程修了（医学博士）。大学院では、心筋症ハムスターの遺伝的地図作製および、その原因遺伝子の同定を行った。１９９５年より理化学研究所研究員、１９９６年より理研マウス完全長ｃＤＮＡプロジェクトに従事し、２０００年ＦＡＮＴＯＭ国際会議、２００２年ＦＡＮＴＯＭ２国際会議の主要メンバーとして活躍。理研ゲノム科学総合研究センターチームリーダーを経て、２００３年より現職。生活習慣病やメタボリック症候群関連遺伝子の遺伝子ネットワーク研究を主体に、比較ゲノム学、機能ゲノム学を駆使しながら、“基礎と臨床の橋渡し”をライフワークとして研究活動を推進している
坊農秀雅［ボウノウヒデマサ］
埼玉医科大学ゲノム医学研究センターゲノム科学部門助教授。１９７３年大阪に生まれる。１９９５年、東京大学教養学部基礎科学科第一卒業。２０００年京都大学大学院理学研究科生物物理専攻生物物理学系博士後期課程（金久研究室）単位取得退学後、理学博士。理化学研究所ゲノム科学総合研究センター遺伝子構造・機能研究グループ基礎科学特別研究員を経て、２００３年４月より埼玉医科大学ゲノム医学研究センター助手、２００３年１０月同講師、２００５年４月より同助教授。専門は生物情報科学。現在、代謝経路とそれを制御するシグナル伝達系の解明に取り組み、低酸素ストレスという一種の環境変化から垣間みられる生物の変動を元にリバースエンジニアリングと比較ゲノムアプローチを武器に、生体内とコンピュータ内での実験をうまく組み合わせることで研究を進めている（本データはこの書籍が刊行された当時に掲載されていたものです）
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